Membrane Protein Bioinformatics Research Group

Rendezetlen szakaszok a transzmembrán fehérjékben

Szerkezeti szempontból a transzmembrán fehérjék membránon átmenő szakaszai nagymértékben rendezettek, de tartalmazhatnak rendezetlen szakaszokat a citoszólikus és extra-citoszólikus részeken. Csoportunk részt vesz a transzmembrán fehérjékben levő rendezetlen szakaszok vizsgálatában. Egy rendezetlen régiókra vonatkozó szigorú definíció alkalmazásával szignifikáns korrelációt találatunk a pozitivan töltött aminosavak és a rendezetlen régiókban levő aminosavak térbeli eloszlása között, egy jelenleg legnagyobb kisérleti adathalmazt használva. Ennek az eredménynek alapján úgy gondoljuk, hogy a rendezetlen szakaszoknak egy új szerepe van a transzmembrán fehérjékben, mégpedig a szerkezeti flexibilitás biztosítása a pozitívan töltött aminosavak és a negatívan töltött lipid fejcsoportok között kialakuló stabilizáló kölcsönhatásokban.

Együttműködő partnerek

  1. Tompa Péter
    VIB Structural Biology Research Center

Témához kapcsolodó közlemények

  1. Dobson L és Tusnády GE (2021) MemDis: Predicting Disordered Regions in Transmembrane Proteins Int. J. Mol. Sci. 22, 12270.
  2. Dobson, L, Meszaros, B és Tusnady, GE (2018) Structural Principles Governing Disease Causing Germline Mutations. J Mol Biol S0022-2836, 31101-X.
  3. Tusnady GE, Dobson L és Tompa P (2015) Disordered regions in transmembrane proteins. Biochim Biophys Acta 1848, 2839-48.
Kövessen bennünket facebook twitter |  MTA |  TTK |  Enzimológiai Intézet |  © Copyright |  Impresszum